Distribution of HIV-1 subtypes in patients with HAART therapeutic failure in the States of Pará and Amazonas, Brazil: 2002 to 2006

Abstract

The aim of this study was to determine the distribution of HIV-1 subtypes in patients undergoing highly active antiretroviral therapy (HAART) therapeutic failure in Amazonas and Pará, two States in northern Brazil, from 2002 to 2006. This study was performed using plasma collected from individuals with human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) and/or acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) who were selected from the National Genotyping Network (Rede Nacional de Genotipagem – RENAGENO). From 2002 to 2006, a total of 127 plasma samples from the States of Amazonas and Pará, in northern Brazil, were obtained from AIDS and/or HIV-positive patients and subjected to genotyping and resistance testing TM using the ViroSeq Genotyping System kit. Using the genetic information obtained from the HIV-1 protease and/or reverse transcriptase regions, HIV-1 subtype B was identified in 85% of the cases, followed by subtype F1 (4.6%) and the recombinant forms BF1 (4.6%) and CF1 (0.8%). The results of this study were similar to the results of other studies conducted in other regions of Brazil, with the exception of the detection of recombinant CF1, which was described for the first time in the Amazon Region.

O objetivo deste estudo foi determinar a distribuição dos subtipos de HIV-1 em pacientes com falha terapêutica à highly active antiretroviral therapy (HAART) nos Estados do Amazonas e Pará, Região Norte do Brasil, entre 2002 e 2006. Este estudo foi realizado utilizando-se soro coletado de indivíduos infectados com o vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1), e/ou portadores da síndrome da imunodeficiência adquirida (aids), selecionados a partir do banco de dados da Rede Nacional de Genotipagem (RENAGENO). Entre 2002 e 2006, foram obtidas 127 amostras sorológicas de pacientes portadores de aids e/ou HIV-positivos dos Estados do Amazonas e Pará, as quais foram submetidas a TM genotipagem e teste de resistência com o kit ViroSeq Genotyping System. Considerando as informações genéticas obtidas das regiões da protease e/ou transcriptase reversa do HIV-1, o subtipo B foi identificado em 85% dos casos, seguido do subtipo F1 (4,6%) e as formas recombinantes BF1 (4,6%) e CF1 (0,8%). Os resultados dessa pesquisa foram semelhantes aos encontrados em estudos realizados em outras regiões do Brasil, exceto pela detecção da forma recombinante CF1, que foi descrita pela primeira vez na Região Amazônica.