Identification of rotavirus G and P genotypes in nursing and weaned piglets in the metropolitan region of Belém, Pará State, Northern Brazil

Abstract

Rotaviruses are an important agent of diarrhea in piglets, primarily during nursing and post-weaning with severity. The aim of this study was to identify rotavirus G and P genotypes obtained from piglets reared at five piggeries in Belém, Pará State, Northern Brazil. Fecal specimens were collected from nursing and weaned piglets. A total of 172 samples were tested, of which 17 (9.9%) were positive for group A rotaviruses all of them from piglets kept at nursing and then were sequenced for the of VP7 and VP4 genotyping. The consistency of positive fecal samples were 53% (9/17) diarrheic, 23.5% (4/17) pasty and 23.5% (4/17) normal. The most common G genotype was G3 representing 53% (9/17), followed by G5 genotype (17%, 3/17). The P genotype recorded was P[23] corresponding to 23.5% (4/17). This study showed that rotaviruses circulated in swine herds in the metropolitan region of Belém, in Northern region. G3P[23] combination was recorded for the first time in Brazil.

Os rotavírus são um importante agente de diarreia em leitões, principalmente durante a amamentação e pósdesmame com gravidade. O objetivo deste estudo foi identificar os genótipos G e P de rotavírus obtidos de leitões de cinco criadouros em Belém, Estado do Pará, Norte do Brasil. Espécimes fecais foram coletados de leitões em fase de amamentação e desmamados. Foi testado um total de 172 amostras, das quais 17 (9,9%) foram positivas para rotavírus do grupo A, a partir de leitões amamentados e, em seguida, foram sequenciadas pela genotipagem do VP7 e VP4. A consistência das amostras de fezes positivas foi de 53% (9/17) diarreico, 23,5% (4/17) pastosa e 23,5% (4/17) normal. O genótipo G mais comum foi o G3 com 53% (9/17), seguido pelo genótipo G5 (17%, 3/17). O genótipo P registrado foi de P[23] que corresponde a 23,5% (4/17). Este estudo mostrou a circulação dos rotavírus em rebanhos suínos na região metropolitana de Belém, na Região Norte. A combinação de G3P[23] foi registrada pela primeira vez no Brasil.