Caracterização genômica e análise filogenética de cepas antigênicamante relacionadas ao vírus Oropouche (Bunyaviridae, Orthobunyavirus) isoladas nas Américas

Abstract

Resumo: O vírus Oropouche (VORO) pertencente à família Bunyaviridae, gênero Orthobunyavirus é o agente etiológico da febre do Oropouche e se apresenta como um dos mais importantes arbovírus causadores de doenças em humanos na Amazônia brasileira, com relevância em saúde pública. Dezenas de epidemias, entre 1961 a 2009, foram registradas nos diferentes centros urbanos da Amazônia brasileira. Também de importância foram as epidemias ocorridas em países como Panamá e Peru. O objetivo deste estudo retrospectivo foi a de caracterizar o genoma completo e descrever a epidemiologia molecular de diferentes cepas do VORO isoladas nas Américas. Para o desenvolvimento desse projeto, foram utilizadas 133 amostras, sendo 24 recebidas do Departamento de Patologia da Universidade do Texas, Galveston, Estados Unidos da América e 109 provenientes do Genbank, de amostras pertencentes à Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas do Instituto Evandro Chagas. As 24 amostras foram cultivadas em células VERO e tratadas com nucleases para posterior extração do RNA viral, empregando kits comerciais. Os RNAs foram submetidos ao sequenciamento pelo Ion Torrent Personal Genome Machine (PGM). As sequências completas obtidas foram avaliadas quanto às características genéticas, à similaridade com outras sequências do VORO disponíveis no Genbank, filogenia e quanto à possibilidade de rearranjo genético. Como resultados principais, detectou-se a presença do genótipo I do VORO no Panamá, bem como se observou rearranjo viral entre as cepas do estudo e os VORO, vírus Iquitos e vírus Madre de Dios. Esses dados serão úteis para uma melhor compreensão da biologia molecular e da epidemiologia molecular desse importante vírus e sua disseminação nas Américas.