Análise metagenômica viral de morcegos coletados nos estados do Pará e Amapá

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2018xmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-files-viewOpen
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http://patua.iec.gov.br//handle/iec/3729xmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-author
Franco Filho, Luciano Chaves
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Nunes, Márcio Roberto Teixeiraxmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-abstract
Vários estudos têm demonstrado que os morcegos são importantes reservatórios naturais de vírus com alta patogenicidade tanto para animais quanto para humanos. Apesar desta associação, existem poucos estudos descrevendo a comunidade viral em morcegos na Amazônia, principalmente trabalhos que envolvam a abordagem metagenômica. Sendo assim, nosso trabalho envolve caracterizar pela primeira vez a comunidade viral das espécies de morcegos presentes em regiões dos estados do Pará e Amapá pela abordagem metagenômica. As coletas foram realizadas entre novembro de 2015 e maio de 2017, nos municípios de Viseu e Carajás, no estado do Pará e nos municípios de Ferreira Gomes e Tartarugalzinho, no estado do Amapá. Foram coletados 74 indivíduos distribuídos em 22 espécies, sendo gerados dados individuais de leituras e contigs tanto para amostras de cérebro quanto para amostras de intestino. A família Retroviridae foi a que possuiu o maior número de contigs e leituras positivas em todas as amostras, enquanto que para as outras famílias, as distribuições variaram de acordo com a localidade e tipo de tecido, refletindo características de cada família viral, como tropismo por tipo de tecido; e características do próprio hospedeiro, como tipo de alimentação e localização. Foram recuperados 4 genomas completos ou quase completos. A partir de tecido cerebral de Desmodus rotundus foi sequenciado um retrovírus endógeno, pertencente ao gênero Betaretrovirus. Uma sequência com similaridade com o sorotipo 4 do Virus Dengue foi sequenciada de Platyrrhinus helleri, enquanto que a de Saccopteryx leptura e Carollia perspicillata, foram recuperados os genomas de sequencias similares com as famílias Astroviridae e Picornaviridae respectivamente. A utilização da ferramenta de metagenômica para a caracterização da microbiota viral se mostrou eficiente, uma vez que, uma grande porcentagem das leituras geradas teve similaridade com sequencias virais. Além da identificação de vírus já conhecidos, a ferramenta mostra grande potencial na identificação de novas cepas virais, atingindo o nosso principal objetivo que é a caracterização da comunidade viral presente em morcegos.
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FRANDO FILHO, Luciano Chaves. Análise metagenômica viral de morcegos coletados nos estados do Pará e Amapá. 119 f. Tese (Doutorado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas, Programa de Pós-Graduação em Virologia, Ananindeua, 2018.xmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-local
Ananindeua / PAxmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-department
Núcleo de Ensino e Pós-Graduaçãoxmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-grantor
Instituto Evandro Chagasxmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-decsPrimary
Quirópteros / virologiaMetagenômica
Vetores de Doenças
Reservatórios de Doenças / virologia
Retroviridae / isolamento & purificação
Viseu (PA)
Carajás (PA)
Ferreira Gomes (AP)
Tartarugalzinho (AP)