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dc.contributor.authorGiovanetti, Marta-
dc.contributor.authorFaria, Nuno Rodrigues-
dc.contributor.authorLourenço, José-
dc.contributor.authorJesus, Jaqueline Goes de-
dc.contributor.authorXavier, Joilson-
dc.contributor.authorClaro, Ingra Morales-
dc.contributor.authorKraemer, Moritz U. G-
dc.contributor.authorFonseca, Vagner-
dc.contributor.authorDellicour, Simon-
dc.contributor.authorThéze, Julien-
dc.contributor.authorSalles, Flavia da Silva-
dc.contributor.authorGraf, Tiago-
dc.contributor.authorSilveira, Paola Paz-
dc.contributor.authorNascimento, Valdinete Alves do-
dc.contributor.authorSouza, Victor Costa de-
dc.contributor.authorIani, Felipe Campos de Melo-
dc.contributor.authorCastilho-Martins, Emerson Augusto-
dc.contributor.authorCruz, Laura Nogueira-
dc.contributor.authorWallau, Gabriel-
dc.contributor.authorFabri, Allison-
dc.contributor.authorLevy, Flávia-
dc.contributor.authorQuick, Joshua-
dc.contributor.authorAzevedo, Vasco de-
dc.contributor.authorAguiar, Renato Santana-
dc.contributor.authorOliveira, Tulio de-
dc.contributor.authorMenezes, Camila Bôtto de-
dc.contributor.authorCastilho, Marcia da Costa-
dc.contributor.authorTerra, Tirza Matos-
dc.contributor.authorSilva, Marineide Souza da-
dc.contributor.authorFilippis, Ana Maria Bispo de-
dc.contributor.authorAbreu, André Luiz de-
dc.contributor.authorOliveira, Wanderson Kleber-
dc.contributor.authorCroda, Julio-
dc.contributor.authorAlbuquerque, Carlos F. Campelo de-
dc.contributor.authorNunes, Marcio Roberto Teixeira-
dc.contributor.authorSabino, Ester Cerdeira-
dc.contributor.authorLoman, Nicholas-
dc.contributor.authorNaveca, Felipe Gomes-
dc.contributor.authorPybus, Oliver G-
dc.contributor.authorAlcantara, Luiz Carlos-
dc.date.accessioned2020-03-28T18:50:30Z-
dc.date.available2020-03-28T18:50:30Z-
dc.date.issued2020-
dc.identifier.citationGIOVANETTI, Marta et al. Genomic and epidemiological surveillance of Zika virus in the Amazon region. Cell Reports, v. 30, n. 7, p. 2275-2283, Feb. 2020.pt_BR
dc.identifier.issn2211-1247-
dc.identifier.urihttp://patua.iec.gov.br//handle/iec/4067-
dc.description.abstractZika virus (ZIKV) has caused an explosive epidemic linked to severe clinical outcomes in the Americas. As of June 2018, 4,929 ZIKV suspected infections and 46 congenital syndrome cases had been reported in Manaus, Amazonas, Brazil. Although Manaus is a key demographic hub in the Amazon region, little is known about the ZIKV epidemic there, in terms of both transmission and viral genetic diversity. Using portable virus genome sequencing, we generated 59 ZIKV genomes in Manaus. Phylogenetic analyses indicated multiple introductions of ZIKV from northeastern Brazil to Manaus. Spatial genomic analysis of virus movement among six areas in Manaus suggested that populous northern neighborhoods acted as sources of virus transmission to other neighborhoods. Our study revealed how the ZIKV epidemic was ignited and maintained within the largest urban metropolis in the Amazon. These results might contribute to improving the public health response to outbreaks in Brazil.pt_BR
dc.description.sponsorshipOxfordNanoporeTechnologiesfortechnicalsupportandQIAGENforsupport of the ZIBRA-2 (Zika in Brazil Real Time Analyses-Second Round)project with reagents and equipment. This work was supported by Decit/SCTIE/MoH and CNPq (440685/2016-8 and 440856/2016-7); by CAPES(88887.130716/2016-00, 88881.130825/2016-00, and 88887.130823/2016-00); by the European Union (EU) Horizon 2020 Programme through ZIKAlliance(PRES-005-FEX-17-4-2-33); by the Medical Research Council and FAPESPCADDE partnership award (MR/S0195/1); and by the Oxford Martin School.N.R.F. is supported by a Sir Henry Dale Fellowship (204311/Z/16/Z).M.U.G.K. is supported by The Branco Weiss Fellowship - Society in Science,administered by ETH Zurich, and acknowledges funding from a Google FacultyAward and a Training Grant from the National Institute of Child Health and Hu-man Development (T32HD040128). S.D. is supported by Fonds National de laRecherche Scientifique (FNRS; Belgium). The activities of the A.M.B.F. labora-tory were supported by the Faperj under the grant no. E-26/2002.930/2016, bytheInternational Development Research Centre (IDRC)Canadaunderthe grant108411-001) and the EU Horizon 2020 Programme through ZikaPlan andZikAction (grants 734584 and 734857). M.G. is supported by Fundac ̧~ao deAmparo a`Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)pt_BR
dc.language.isoengpt_BR
dc.publisherElsevierpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.titleGenomic and epidemiological surveillance of Zika virus in the Amazon regionpt_BR
dc.typeArtigopt_BR
dc.subject.decsPrimaryZika virus / patogenicidadept_BR
dc.subject.decsPrimaryZika virus / isolamento & purificaçãopt_BR
dc.subject.decsPrimaryInfecção por Zika virus / transmissãopt_BR
dc.subject.decsPrimaryInfecção por Zika virus / genéticapt_BR
dc.subject.decsPrimarySurtos de Doençaspt_BR
dc.subject.decsPrimaryManaus (AM)pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brazil / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil / University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversity of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brazilpt_BR
dc.creator.affilliationUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversidade de São Paulo. Instituto de Medicina Tropical. São Paulo, SP, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversity of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil / University of KwaZuluNatal. College of Health Sciences. KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. Durban, South Africa.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversite ́Libre de Bruxelles. Spatial Epidemiology Lab. Bruxelles, Belgium / KU Leuven. Department of Microbiology and Immunology. Rega Institute. Laboratory for Clinical and Epidemiological Virology. Leuven, Belgium.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversity of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversidade de São Paulo. Instituto de Medicina Tropical. São Paulo, SP, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversidade Federal do Amapá. Faculdade de Medicina. Macapá, AP, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brazilpt_BR
dc.creator.affilliationUniversity of Birmingham. Institute of Microbiology and Infection. Birmingham, UK.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversity of Birmingham. Institute of Microbiology and Infection. Birmingham, UK.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversity of Birmingham. Institute of Microbiology and Infection. Birmingham, UK.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversity of KwaZuluNatal. College of Health Sciences. KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. Durban, South Africa.pt_BR
dc.creator.affilliationUniversidade do Estado do Amazonas. Manaus, AM, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação de Medicina Tropical Doutor Heitor Vieira Dourado. Departamento de Virologia. Manaus, AM, Brasil.pt_BR
dc.creator.affilliationLaboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationLaboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil.pt_BR
dc.creator.affilliationMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Departamento de Vigilância de Doenças Transmissíveis. Brasília, DF, Brasil.pt_BR
dc.creator.affilliationOrganização Pan-Americana da Saúde / Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationMinistério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasilpt_BR
dc.creator.affilliationUniversity of Birmingham. Institute of Microbiology and Infection.Birmingham, UK.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brazil.pt_BR
dc.creator.affilliationFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brazil / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil.pt_BR
dc.identifier.doi10.1016/j.celrep.2020.01.085-


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